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m1A RNA甲基化是一類新發現的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修飾。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA豐度很高的一種轉錄后修飾，近期研究也表明m1A修飾可調控mRNA翻譯。m1A修飾作為一類新型RNA甲基化，其功能和機制都亟待挖掘。
與m6A RNA檢測方式一致，針對m1A修飾也采用MeRIP-seq技術，抗體富集的技術原理如下：將m1A RNA甲基化特異性抗體與被隨機打斷的RNA片段進行共孵育，抓取有甲基化修飾的片段進行測序；同時需要平行測序一個對照（Input）樣本，對照樣本為未進行IP反應的RAN片段，對照樣本用于消除非特異性抓取甲基化片段的背景。
云序生物m1A RNA-seq實驗流程
云序優勢
云序生物具有強大的生物信息學團隊，能夠滿足客戶的各類深入數據分析要求。
樣本要求
細胞： > 1×108
組織： > 5 g
總RNA：> 300 μg (OD260/280≥1.8；OD260/230≥1.5；無明顯降解，電泳檢測樣品特征性條帶完整清晰，無明顯彌散或拖尾 28S：18S≥1.5或者RIN≥7）
數據分析（下列有※表示個性化分析）
1、RNA甲基化富集峰分布圖※
2、RNA甲基化位點motif分析※
3、RNA甲基化富集峰可視化圖
4、差異甲基化區的GO和KEGG信號通路分析
案例解析
案例1：真核生物mRNA中m1A的動態修飾研究
原文：The dynamic N1-methyladenosine methylome in eukaryotic messenger RNA
芝加哥大學等處的科學家在國際雜志Nature上發表的一項研究論文，該研究通過m1A RNA甲基化測序技術在真核生物mRNA中對m1A甲基化作用進行全 面的分析，揭示了m1A修飾可以明顯增強基因向蛋白質的表達過程。并且m1A修飾具有進化保守性，在人類、嚙齒類動物及酵母中普遍存在。
原文：Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts
案例3：細胞核和線粒體編碼的轉錄本的m1A甲基化修飾-Base-Resolution
期刊：Molecular Cell 影響因子：13.84
本研究通過單堿基分辨率方法的m1A RNA甲基化測序技術鑒定了細胞核和線粒體中m1A 甲基化修飾位點。結果發現大多數m1A甲基化修飾富集在mRNA的5’UTR，小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位點由一個已知的甲基化酶復合物TRMT6/61A 修飾。此外，線粒體編碼的轉錄本中也有大量的m1A 甲基化修飾。該研究還表明，位于5’UTR 區，尤其是轉錄本第 一和第二位上的m1A 可促進mRNA 翻譯，而位于編碼區的m1A 可抑 制翻譯作用。因此，m1A 測序不僅揭示了核編碼和線粒體編碼的轉錄本上不同類型的m1A 甲基化修飾，還為進一步m1A 甲基化功能驗證提供了重要工具。
技術簡介
m1A RNA甲基化是一類新發現的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修飾。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA豐度很高的一種轉錄后修飾，近期研究也表明m1A修飾可調控mRNA翻譯。m1A修飾作為一類新型RNA甲基化，其功能和機制都亟待挖掘。
與m6A RNA檢測方式一致，針對m1A修飾也采用MeRIP-seq技術，抗體富集的技術原理如下：將m1A RNA甲基化特異性抗體與被隨機打斷的RNA片段進行共孵育，抓取有甲基化修飾的片段進行測序；同時需要平行測序一個對照（Input）樣本，對照樣本為未進行IP反應的RAN片段，對照樣本用于消除非特異性抓取甲基化片段的背景。
云序生物m1A RNA-seq實驗流程
云序優勢
云序生物具有強大的生物信息學團隊，能夠滿足客戶的各類深入數據分析要求。
樣本要求
細胞： > 1×108
組織： > 5 g
總RNA：> 300 μg (OD260/280≥1.8；OD260/230≥1.5；無明顯降解，電泳檢測樣品特征性條帶完整清晰，無明顯彌散或拖尾 28S：18S≥1.5或者RIN≥7）
數據分析（下列有※表示個性化分析）
1、RNA甲基化富集峰分布圖※
2、RNA甲基化位點motif分析※
3、RNA甲基化富集峰可視化圖
4、差異甲基化區的GO和KEGG信號通路分析
案例解析
案例1：真核生物mRNA中m1A的動態修飾研究
原文：The dynamic N1-methyladenosine methylome in eukaryotic messenger RNA
芝加哥大學等處的科學家在國際雜志Nature上發表的一項研究論文，該研究通過m1A RNA甲基化測序技術在真核生物mRNA中對m1A甲基化作用進行全 面的分析，揭示了m1A修飾可以明顯增強基因向蛋白質的表達過程。并且m1A修飾具有進化保守性，在人類、嚙齒類動物及酵母中普遍存在。
原文：Base-Resolution Mapping Reveals Distinct m1A Methylome in Nuclear- and Mitochondrial-Encoded Transcripts
案例3：細胞核和線粒體編碼的轉錄本的m1A甲基化修飾-Base-Resolution
期刊：Molecular Cell 影響因子：13.84
本研究通過單堿基分辨率方法的m1A RNA甲基化測序技術鑒定了細胞核和線粒體中m1A 甲基化修飾位點。結果發現大多數m1A甲基化修飾富集在mRNA的5’UTR，小部分符合“GUUCRA”基序的m1A 位點由一個已知的甲基化酶復合物TRMT6/61A 修飾。此外，線粒體編碼的轉錄本中也有大量的m1A 甲基化修飾。該研究還表明，位于5’UTR 區，尤其是轉錄本第 一和第二位上的m1A 可促進mRNA 翻譯，而位于編碼區的m1A 可抑 制翻譯作用。因此，m1A 測序不僅揭示了核編碼和線粒體編碼的轉錄本上不同類型的m1A 甲基化修飾，還為進一步m1A 甲基化功能驗證提供了重要工具。
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